森田駅は官営鉄道の北陸線が小松まで開通した１８９７(明治３０)年９月２０日に開業した。駅ができた当時は吉田郡森田村だったが、１９３５(昭和１０)年４月３日に単独で町制施行１９６７(昭和４２)年７月３０日に福井市へ編入合併した。それまでは森田町の中心に位置した。
　ホームは相対式で、時刻表とも番線表示はなく、駅舎側が福井方面、跨線橋を渡って反対側が金沢方面になっている。
　駅舎は開業当初のもので、線路と道路の段差があり、入口には階段がある。また、かつてどの駅でも見ることのできた、列車が到着するまで小荷物、手荷物を置いておく集積場が残っている。ここへは道路からスロープとなっている。
　５２１系の導入に際して行われたホームの嵩上げで金沢方面ホームの待合室が撤去され、跨線橋階段前に風除室が設けられた。どの駅でも跨線橋階段で待つ人が多く、ホームの待合室は利用されていないが、最近の橋上駅にある冷暖房付きの待合室は利用する人が多い。跨線橋は改修され現在、外壁が青色に変わっている。
　駅舎福井側に大規模駐輪場、金沢駅側と福井駅側にパークアンドライド駐車場がある。駅東側に福井市役所森田連絡所、森田小学校、南側に仁愛女子短大、天池河川公園北側に福井市北体育館がある。
　駅に売店は無いが、徒歩５分ほどの県道３０号線沿いにファミリーマート森田店があり食料などを調達できる。訪れた時は森田郵便局前にあったが、２０１４年６月に旧ダナックス本社跡地へ移転した。県道３０号線は旧国道８号線でフェニックス(不死鳥)通りと呼ばれている。福井市が戦災と
福井地震による震災から不死鳥のごとく復旧したのに由来している。駅前の通りは県道１２５号森田停車場線で駅から県道３０号線までの僅か約１２０ｍ。その先の県道１１２号はルート変更となり、現在は福井市道となっている。
　２０２４年３月１６日北陸新幹線 金沢− 敦賀間開業に伴いハピラインふくいに移管され、無人駅となった。