南条駅は北陸線が福井まで開通した１８９６(明治２９)年７月１５日に鯖波駅として開業した。駅ができた当時は北杣山村だったが、湯尾駅との間にある宿場町の鯖波から名を採って鯖波駅となった。現駅名になったのは１９７３(昭和４８)年４月１日である。ホームは片面ホームと島式ホームを組み合わせた国鉄型だが島式ホーム内側の待避線は撤去されている。現在、旧待避線側には転落防止の柵が設置されている。
　駅舎側が敦賀方面、島式ホーム外側が福井方面となっている。簡易依託駅で駅舎は商工会と一体になっている。窓口の営業時間は７時から１０時までと１５時から１９時３０分までで、Ｂ−ＰＯＳ発券機が設置されている。無人時間帯用に近距離用の券売機も設置されている。
　福井寄りに２階建ての駐輪場、１回１００円の駐車場、敦賀寄りに月極のパークアンドライド駐車場が設置されている。ホームは駅舎２階と同じ高さで駅舎側ホームも階段を利用する。福井方面ホームとは地下道で結ばれている。
　駅付近は南条町の中心で南越前町庁舎、南条小学校、南条中学校、南条消防署などがある。日野川の河川敷にはレインボーパーク南条がある。この付近は西側から北陸本線、国道３６５号線、北陸自動車道が併走している。国道８号線は武生から海岸沿いを走るので離れている。国道３６５号線は南今庄を過ぎてから県境を越え滋賀県余呉町へ向かうが、分岐した国道４７６号線が木ノ芽峠トンネル(１７８３ｍ)を抜けて敦賀へ向かう。